Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT9Q86SS6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms