Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLNKQ7Z7G1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms