Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms