Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms