Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZS62

COLCA1, Colorectal cancer-associated protein 1, humanhuman

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA1Q6ZS62 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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COLCA1Q6ZS62 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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COLCA1Q6ZS62 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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COLCA1Q6ZS62 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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COLCA1Q6ZS62 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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COLCA1Q6ZS62 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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COLCA1Q6ZS62 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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COLCA1Q6ZS62 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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COLCA1Q6ZS62 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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COLCA1Q6ZS62 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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