Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms