Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms