Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG16L1Q676U5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms