Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms