Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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