Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms