Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms