Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms