Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms