Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0N0

GGTA1P, Inactive N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTA1PQ4G0N0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GGTA1PQ4G0N0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GGTA1PQ4G0N0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GGTA1PQ4G0N0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GGTA1PQ4G0N0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GGTA1PQ4G0N0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GGTA1PQ4G0N0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms