Protein–RNA interactions for Protein: Q495D7

LINC01559, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01559, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01559Q495D7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01559Q495D7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms