Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms