Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
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