Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms