Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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