Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC1Q15915 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms