Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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