Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
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