Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
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