Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
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