Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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PTPRRQ15256 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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PTPRRQ15256 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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PTPRRQ15256 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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PTPRRQ15256 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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PTPRRQ15256 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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PTPRRQ15256 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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PTPRRQ15256 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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PTPRRQ15256 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
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