Protein–RNA interactions for Protein: Q15050

RRS1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRS1Q15050 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RRS1Q15050 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms