Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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