Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
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