Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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