Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOFQ13790 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOFQ13790 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOFQ13790 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOFQ13790 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOFQ13790 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOFQ13790 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOFQ13790 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOFQ13790 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOFQ13790 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOFQ13790 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOFQ13790 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOFQ13790 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOFQ13790 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOFQ13790 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOFQ13790 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOFQ13790 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOFQ13790 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APOFQ13790 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOFQ13790 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOFQ13790 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOFQ13790 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOFQ13790 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APOFQ13790 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APOFQ13790 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOFQ13790 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOFQ13790 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOFQ13790 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOFQ13790 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOFQ13790 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOFQ13790 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOFQ13790 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOFQ13790 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOFQ13790 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOFQ13790 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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