Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
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