Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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