Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
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