Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATRQ13535 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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