Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PICALMQ13492 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PICALMQ13492 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PICALMQ13492 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PICALMQ13492 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PICALMQ13492 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PICALMQ13492 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PICALMQ13492 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PICALMQ13492 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PICALMQ13492 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PICALMQ13492 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PICALMQ13492 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PICALMQ13492 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PICALMQ13492 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PICALMQ13492 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PICALMQ13492 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PICALMQ13492 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PICALMQ13492 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PICALMQ13492 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PICALMQ13492 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PICALMQ13492 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PICALMQ13492 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PICALMQ13492 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PICALMQ13492 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PICALMQ13492 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PICALMQ13492 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PICALMQ13492 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PICALMQ13492 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PICALMQ13492 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PICALMQ13492 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PICALMQ13492 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PICALMQ13492 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PICALMQ13492 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PICALMQ13492 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PICALMQ13492 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PICALMQ13492 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PICALMQ13492 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PICALMQ13492 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PICALMQ13492 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PICALMQ13492 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PICALMQ13492 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PICALMQ13492 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PICALMQ13492 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PICALMQ13492 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PICALMQ13492 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PICALMQ13492 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PICALMQ13492 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PICALMQ13492 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PICALMQ13492 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PICALMQ13492 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PICALMQ13492 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PICALMQ13492 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PICALMQ13492 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PICALMQ13492 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PICALMQ13492 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PICALMQ13492 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
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