Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
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