Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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