Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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CALCOCO2Q13137 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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CALCOCO2Q13137 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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CALCOCO2Q13137 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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CALCOCO2Q13137 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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CALCOCO2Q13137 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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CALCOCO2Q13137 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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CALCOCO2Q13137 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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CALCOCO2Q13137 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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CALCOCO2Q13137 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
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