Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP4Q13115 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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