Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms