Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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RAB40BQ12829 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
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RAB40BQ12829 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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RAB40BQ12829 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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RAB40BQ12829 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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RAB40BQ12829 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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RAB40BQ12829 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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RAB40BQ12829 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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RAB40BQ12829 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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RAB40BQ12829 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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