Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms