Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms