Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms