Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms