Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV1Q03135 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms