Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 OR52B5P-203ENST00000641694 1313 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AC135068.1-201ENST00000332663 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 PTMA-204ENST00000409683 933 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 HEXB-205ENST00000509579 806 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 HERC2P5-202ENST00000564458 1164 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 HERC2P8-203ENST00000564795 1164 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 TXNDC9-202ENST00000409434 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 LINC00879-205ENST00000470465 757 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms