Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms