Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTCQ00610 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms